PISM
应用介绍
PISM是一款广泛用于科学计算的开源工具。
使用指南
通过slurm提交脚本的方式来提交作业
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=40
module load app/pism/1.2.1
scontrol show hostnames $SLURM_JOB_NODELIST > mf
cat mf mf | sort > mmf
ulimit -a
mpirun -genv I_MPI_DEBUG 3 -machinefile mmf -np $SLURM_NPROCS /opt/app/pism/pismr -i pism_Greenland_5km_v1.1.nc -bootstrap -Mx 76 -My 141 -Mz 101 -Mbz 11 -z_spacing equal -Lz 4000 -Lbz 2000 -skip -skip_max 10 -grid.recompute_longitude_and_latitude false -grid.registration corner -ys -10000 -ye 0 -surface given -surface_given_file pism_Greenland_5km_v1.1.nc -front_retreat_file pism_Greenland_5km_v1.1.nc -sia_e 3.0 -ts_file ts_g20km_10ka.nc -ts_times -10000:yearly:0 -extra_file ex_g20km_10ka.nc -extra_times -10000:100:0 -extra_vars diffusivity,temppabase,tempicethk_bas
al,bmelt,tillwat,velsurf_mag,mask,thk,topg,usurf -o g20km_10ka.nc
参考作业提交，用sbatch提交作业脚本。